本作承接《奥特银河格斗2：巨大阴谋》，讲述奥特英雄们与阿布索留特人之间惊动银河的命运之战。　　同时新的奥特战士——雷古洛思奥特曼和阿布索留特人的战士——迪亚波罗亦将登场。

魔爪伸向了M78星云·光之国！受到了不知是谁的攻击，被铭刻在脉搏上的“新生代奥特曼”的记忆丢失了。接受了“对奥特曼羁绊的挑战”的光之国，又一讯息到来了。那是新的光之道具“次元格斗仪”，上面托付了未来人的信息。为了找回丢失的…

原偶像组合在结束最后的公演后，成员沙奈就被不明人士带到了陌生的孤岛，孤岛上还有其他被绑架来的偶像。慌乱之中，一位名叫TAKIMOTO的男人突然出现，宣布游戏开始。这个游戏是淘汰制的卡牌游戏，最终获得胜利的人将成为超级偶像。继承了…

在父亲经营的小卖店工作的凑活海与大学生的凑勇海两兄弟与妹妹和父亲一同生活在一起，城市中突然出现未知巨大生物，兄弟二人获得了罗布回旋闪光和罗布水晶和奥特力量。前期兄弟俩刚刚得到奥特力量，还不能完全熟悉，因此也产生了很多危机…

被称作奥特黑暗杀手的黑暗魔人，具有创造奥特战士的黑暗战士的能力。赛罗奥特曼和格丽乔奥特曼落入了黑暗杀手之手！为了应对这场危机，泰罗奥特曼召集了“新世代英雄”，银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼、欧布奥特曼、捷德奥特…

绫香市已经有一年多没出现过怪兽了。凑家一家人开始朝着自己的梦想努力奋斗。可是，唯独只有活海还没有想好未来究竟想要干什么。活海有一位高中同学叫户井。当年，户井立志要学游戏制作。他们毕业后就没再见过了，活海打算去找户井叙叙旧…

绫香市已经有一年多没出现过怪兽了。凑家一家人开始朝着自己的梦想努力奋斗。可是，唯独只有活海还没有想好未来究竟想要干什么。活海有一位高中同学叫户井。当年，户井立志要学游戏制作。他们毕业后就没再见过了，活海打算去找户井叙叙旧…

路基艾尔埃塔尔加等曾经的奥特战士宿敌接连苏醒神秘的黑暗奥特战士也相继登场新生代英雄们遭遇了不测是谁在背后操纵着这一切